L’Église protestante évangélique CMA de Côte d’Ivoire est organisée en différents démembrements pour son fonctionnement spirituel et administratif. Elle est subdivisée en :
- Régions (constituées chacune de plusieurs districts) ;
- Districts (constitués chacun de plusieurs paroisses) ;
- Districts missionnaires ;
- Paroisses (constituées chacune de plusieurs communautés locales);
- Communautés locales ;
- Champs missionnaires ;
- Champs missionnaires à l’étranger (Ghana, Togo et France).
L’Eglise CMA compte à ce jour 30 Régions, 147 Districts, 07 Districts missionnaires, 687 Paroisses, 4 660 Communautés locales, 150 Champs missionnaires et 03 Champs missionnaires à l’étranger (Ghana, Togo et France).